Вступление России в ВТО отменяет таможенные преференции для российских товаров в странах, входящих в ВТО. Следовательно,  доходы палаты от услуг экспертизы и сертификации страны происхождения товаров значительно снизятся.  А ведь доходы от этих услуг  являются одним из значимых источников финансирования уставной деятельности палаты. Следовательно, требуется значительная диверсификация деятельности палаты, расширение спектра услуг, разработка стратегии деятельности в условиях повышения конкуренции.

Потребуются дополнительные расходы палаты на привлечение сторонних экспертов либо подготовку собственных специалистов, способных оказывать томскому предпринимательскому сообществу компетентные консультации по ведению бизнеса в условиях членства в ВТО.

В связи со вступлением России в ВТО обострится ситуация с охраной интеллектуальной собственности. Крупные иностранные компании, которые пока только предпринимали робкие шаги по защите своих прав, теперь могут заявить о них более решительно и потребовать от соответствующих структур более решительных действий в пресечении нарушения авторских прав, вплоть до предоставления закрытой оперативной информации о правонарушителях. Следовательно, палата должна грамотно выстроить отношения по защите интеллектуальной собственности как томских предпринимателей, так и  иностранных участников рынка.

Появление на российском рынке новых иностранных компаний (прямых представительств) повлечет необходимость выстраивания новых отношений в работе территориальных палат с ними. Чтобы отвечать мировому уровню, появится необходимость повышения стандартов работы, расширения перечня оказываемых услуг и привлечения высококлассных и высокооплачиваемых специалистов для удовлетворения нужд иностранных компаний.

Приход на российский рынок высококвалифицированных сервисных зарубежных компаний повлечет рост качества оказываемых услуг. Возможно возникновение конкуренции с территориальными ТПП на рынке услуг для малого и среднего бизнеса, что повлечет увеличение затрат ТПП на привлечение более высокооплачиваемых специалистов для улучшения качества оказываемых услуг.

Появится необходимость в разработке новых механизмов поддержки экспортно ориентированных российских компаний, чтобы оказывать им помощь в выходе на мировой рынок (новые механизмы работы отделов ВЭД).